El servicio de urología del Hospital Militar central tiene la misión de brindar servicio especializado en urología, a la fuerza operativa de nuestro Ejército, y a sus familiares.

El servicio de urología brinda servicios especializados en urología general, oncológica, endourología, urología femenina y andrológia.

Además el servicio de urología es sede docente de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Universidad Peruana Cayetano Heredia, para la formación de los alumnos de pre grado, y residentado medico.

Tiene un departamento de educación encargado de la formación docente de los residentes, internos, e intercambio científico con otros centros tanto nacionales como extranjeros, y la organización del congreso de urología de las FFAA cada dos años.